Les thématiques de recherche du LBBE s’organisent autour d’un point de vue méthodologique, qui affirme l’importance de la modélisation mathématique ou informatique, et d’une perspective évolutive portant sur tous les niveaux d’organisation biologique, du génome à l'écosystème. C’est dans la synergie entre des problématiques biologiques propres et des développements méthodologiques que naît la majorité des résultats scientifiques du laboratoire.
Les thématiques scientifiques partagées avec VetAgro Sup concernent les champs de l’écologie, des agents pathogènes et de la modélisation avec quatre volets :
Le LBBE rassemble 122 permanents et autant de doctorants et postdorants.
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